Pymol

Pymol

PyMOL is a molecular graphics system with an embedded Python interpreter designed for real-time visualization and rapid generation of high-quality molecular graphics images and animations. It can also perform many other valuable tasks (such as editing PDB files) to assist you in your research.

            Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah mengetahui bentuk molekul, Van der Walls radius, hingga mesh yang dimiliki  oleh suatu molekul.

Berikut cara mudahnya :

Pertama kita harus membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.

pymol1

 

Klik toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita pilih fitur Residue  Alanine.

pymol3

 

kemudian apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa pilih fitur L-toolbar  other properties  formal charge

pymol4

 

jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar  vdw radius

pymol5

 

 

untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar  element symbol

pymol6


pilih S-toolbar  dots

pymol7

 

dan kemudian jika ingin mengetahui mesh dan surface pilih S-toolbar mesh dan S-toolbar  surface

pymol8

 

pymol9

 

Get view dan kemudian Orient

pymol10

Mudah bukannnn???

Selamat Mencoba dan Terima Kasih🙂

 

 

Tinggalkan Balasan

Isikan data di bawah atau klik salah satu ikon untuk log in:

Logo WordPress.com

You are commenting using your WordPress.com account. Logout / Ubah )

Gambar Twitter

You are commenting using your Twitter account. Logout / Ubah )

Foto Facebook

You are commenting using your Facebook account. Logout / Ubah )

Foto Google+

You are commenting using your Google+ account. Logout / Ubah )

Connecting to %s